При выращивании безгоршечной рассады посев проводят в заправленный минеральными удобрениями грунт теплицы, а при горшечном способе – в горшки или кубики. Естественно, что горшечная рассада при пересадке растений на постоянное место практически полностью сохраняет корневую систему, что значительно сокращает сроки акклиматизации растений на новом месте. На посадку горшечной рассады затрачивается меньше времени и воды для полива молодых растений. Высаженная горшечная рассада меньше, чем безгоршечная, нуждается в поливах в первое время после посадки, меньше повреждается заморозками. Однако выращивание горшечной рассады – более трудоемкая операция, но с появлением автоматизированных поточных линий, производство рассады практически полностью осуществляется горшечным способом. Исключение составляет лук репчатый, лук порей и сельдерей. Не следует выращивать рассаду без горшков или питательных кубиков растений, плохо переносящих пересадку: перца, пекинской капусты, бамии, растений семейства тыквенные (огурец, дыня, тыква, кабачки).