В. Г. Минеев (1998), подчеркивая безальтернативность разумного использования всех видов удобрений и химических мелиорантов, сформулировал следующие функциональные задачи, требующие решения:
- оптимизация питания культурных растений биогенными макро- и микроэлементами с учетом усиления деятельности физиологических барьеров, препятствующих поступлению токсических элементов в растения, особенно в генеративную их часть, составляющую продукцию растениеводства;
- воспроизводство плодородия, улучшение свойств и гумусового состояния почв;
- поддержание активного баланса и малого круговорота биогенных элементов в земледелии с учетом оптимального их соотношения в агроэкосистеме;
- создание оптимальных культурных агрогеохимических ландшафтов для различных природных регионов в соответствии с их специализацией;
- снижение негативных последствий от глобального и локального техногенного загрязнения агроэкосистем тяжелыми металлами и другими токсическими элементами;
- улучшение радиационно-экологической ситуации в агроэкосистеме;
- регулирование биологических показателей агроэкосистемы;
- улучшение химического состава и питательной ценности растениеводческой продукции.
Вполне очевидна как агрохимическая, так и экологическая  заданность приведенных задач, формирующих системный каркас оптимальной и в  хозяйственном, и в природоохранном отношении химизации земледелия.
  Признавая исключительно важную роль агрономической химии в  увеличении производства продуктов питания для человека и кормов для животных,  улучшении качества продукции, а в целом и в повышении эффективности  сельскохозяйственного производства, нельзя не отметить, что те же самые химические  средства при неправильном их использовании могут оказывать и оказывают  негативное воздействие на окружающую среду. Именно неграмотное использование  средств химизации, нарушение существующих регламентов служат источником  наблюдающихся отрицательных последствий.
  Основными причинами загрязнения окружающей среды  удобрениями считают несовершенство организационных форм, а также технологий  транспортировки, хранения, тукосмешения и применения удобрений, нарушение  агрономической технологии их внесения в севообороте и под отдельные культуры  (в том числе неумеренное или несбалансированное), несовершенство самих удобрений,  их химических, физических и механических свойств.
  Неблагоприятное влияние удобрений на окружающую природную  среду, те или иные компоненты агроценозов может быть самое различное (загрязнение  почв, поверхностных и грунтовых вод, усиление эвтрофирования водоемов,  уплотнение почв; нарушение круговорота и баланса питательных веществ,  ухудшение агрохимических свойств и плодородия почвы; ухудшение фитосанитарного  состояния посевов и развитие болезней растений, снижение продуктивности  сельскохозяйственных культур и качества получаемой продукции и т. д.).
  Большинство минеральных удобрений характеризуется  физиологической кислотностью, поэтому их применение в избыточных количествах  обусловливает развитие процессов подкисления почв. Кроме того, это приводит к  снижению суммы поглощенных оснований, усилению минерализационных процессов,  нарушению соотношения подвижных форм макро- и микроэлементов в почве и  элементного состава растений. Так, внесение высоких доз азотных удобрений под  капусту приводит к нарушению обмена и поступления серы в растения, что  отрицательно сказывается на качестве урожая. В результате подкисления  почвенного раствора фосфаты фиксируются почвой, что ухудшает фосфорное питание  растений; кроме того, при этом высвобождаются ионы алюминия, которые токсичны  для почвенной биоты и растений.
  Избыток минеральных удобрений вызывает нарушения в  биологической компоненте почвы, вследствие чего нарушаются процессы  трансформации органического вещества. Кроме того, увеличивается доля  микроскопических грибов (среди которых много патогенов) в структуре микробного  ценоза. Это грозит опасностью образования микотоксинов в почве, продуктах  питания и т. д.
  Избыточное применение азотных удобрений может приводить к  накоплению нитратов в почве и сельскохозяйственной продукции. С фосфорными  удобрениями в почву попадают многочисленные токсичные элементы, малоподвижные в  почвенной среде (As, Se, Co, Ni, Cu, Pb, W, Cd, Cr, Zn, токсичные соединения фтора). В природных фосфатах имеются в наличии  радиоактивные элементы – уран, радий, стронций. Увеличение содержания фосфора в  природных водах из-за потерь при транспортировке (34%), поверхностного стока и  вымывания из почв (21%), «выпадения» фосфора из аграрного круговорота (почти  полное отсутствие утилизации органических веществ в коммунальном хозяйстве и  снижением до 50%-го уровня утилизации органических веществ в животноводстве,  45% всех поступлений) приводит к эвтрофированию водных объектов: цветению воды,  ухудшению условий непосредственного водопотребления.
  При переработке на калийные удобрения образуются галитовые  отвалы, глинисто-солевые шламы, а также пылегазовые выбросы. Солеотвалы  занимают значительные площади и являются источником засоления почв и подземных  вод. Захороненные глинисто-солевые шламы вызывают заболачивание и засоление  почв. Балластные элементы (Cl, Na) при систематическом применении  повышенных доз удобрений накапливаются в почве и снижают ее плодородие,  попадают в грунтовые воды, повышая в них концентрацию солей. Немалую опасность  могут представлять содержащиеся в калийных удобрениях металлы (Cd, Hg, Pb, Al),  которые могут накапливаться в живых организмах, проникать в грунтовые воды и  т.д.
  Снижения потерь питательных элементов минеральных удобрений  вследствие вымывания можно достичь как агротехническими, так и химическими  способами. Среди последних представляет интерес применение медленнодействующих  удобрений, питательные элементы которых усваивались бы растениями постепенно,  в течение всего периода вегетации. Этого можно достичь с помощью  капсулирования, покрытия синтетической оболочкой (смолы, парафины, полиэтилен и  др.) или элементарной серой. Результаты экспериментов, проведенных в бывшей  Чехословакии, показали, что благодаря покрытию удобрений полиэтиленовой  оболочкой коэффициент использования калия кукурузой можно увеличить с 30 до  50%. Результаты проведенных в США опытов по применению капсулированных  удобрений показали, что покрытие их винилацетатной оболочкой привело к  снижению потерь калия с 86до 30%, а покрытие туков парафином – до 5,4 %.  Однако данных для однозначных рекомендаций по вопросам использования  капсулированных удобрений пока недостаточно.
  Следует обратить внимание и на следующие обстоятельства. В  системе удобрений важное значение имеют органические удобрения. Но создать  высокопродуктивные почвы только за счет органических удобрений невозможно. При  достаточном количестве органических удобрений в хозяйстве баланс гумуса в почве  может быть положительным. Однако обеспечение бездефицитного баланса фосфора и  калия без применения минеральных удобрений достаточно проблематично. Кроме  того, даже систематическое применение органических удобрений не позволяет  добиться оптимального соотношения основных элементов питания в определенные  периоды роста и развития, поскольку все культуры на первых фазах развития  требуют обязательного наличия фосфора, озимые – весенней подкормки азотными  удобрениями, многолетние травы – поукосного удобрения и т. д. Действие органических  и минеральных удобрений на растения и почву различно. Питательные вещества из  минеральных удобрений (особенно азотных и частично калийных) максимально  используются растениями почти сразу же после их внесения, а из органических –  постепенно, по мере минерализации органического вещества. Поэтому при необходимости  быстрого воздействия на питание растений следует вносить минеральные  удобрения. Если последние в основном улучшают питательный режим почвы, то  органические удобрения наряду с этим обогащают ее гумусом, улучшают  физико-химические свойства, увеличивают активность почвенной микрофлоры.  Внесение органических удобрений в сочетании с минеральными превосходит по  своей эффективности воздействие эквивалентного количества питательных веществ  применяемых раздельно органических или минеральных удобрений. Только использование  органо-минеральной системы удобрений в сочетании с другими агротехническими и  биологическими приемами создает надежную основу для повышения плодородия почв,  роста урожайности сельскохозяйственных культур, регулирования качества продукции  и минимизации отрицательного воздействия на окружающую природную среду.
